Если перестаёшь быть налоговым резидентом, с точки зрения ИИС, при продаже активов с брокерского счета-прибыль будет облагаться в размере 30%?

Да, согласно ст. 224 п. 3 НК РФ нерезидент платит налог на доход в размере 30%.